你知道你培養(yǎng)的細胞還是不是原來的細胞?
要說一個實驗汪怕什么,細胞養(yǎng)死了是*
但是,還有一種情況更絕望,那就是——細胞還好好的,但是這個細胞它已經(jīng)不是它!
所以,你新買到的細胞、實驗室傳了幾代的細胞、又或者儲存于超低溫冰箱幾年不用的細胞,它真的還是原來的那個細胞嗎?
其實細胞系認證的問題已經(jīng)存在了幾十年,2017年,有機構(gòu)研究抽查了中國28個研究機構(gòu)中保存的278個細胞系,并對細胞進行鑒定。
調(diào)查結(jié)果顯示,有128個細胞系是錯誤鑒定的,錯誤率高達46%。
因使用了交叉污染或錯誤辨識的細胞而導(dǎo)致研究結(jié)論錯誤、結(jié)果不可重復(fù)、臨床細胞**災(zāi)難性后果……這浪費大量時間、精力和金錢。
細胞系被錯誤識別,往小了說會浪費時間和金錢,導(dǎo)致結(jié)果不可重復(fù)性,文獻被退回;
往大了講還可能對人類健康產(chǎn)生潛在的威脅,、疫苗和其它生物都是以實驗室的研究發(fā)現(xiàn)為基礎(chǔ)而產(chǎn)生的,往往都是跟細胞培養(yǎng)相關(guān)。
細胞是一種很特殊的商品,由于其具有可復(fù)制性,因此很容易被自行復(fù)制后進行出售傳播,而這些自行傳代復(fù)制的細胞幾乎*,所以很容易引起大家購買。
但是這些細胞傳代的次數(shù)、培養(yǎng)的條件以及是否有污染等都無法得到保障,等你實驗焦頭爛額毫無進展卻突然發(fā)現(xiàn)是細胞被污染了,那滋味真的是不好受的!
有沒有想過細胞STR鑒定?!
細胞STR鑒定是什么?——給你的細胞一個“明明白白的”身份!
STR,全稱Shorttandemrepeat,中文名“短串聯(lián)重復(fù)序列”,是一類廣泛存在于真核生物基因組中的DNA串聯(lián)重復(fù)序列,其核心序列2~7bp,重復(fù)次數(shù)通常為10~30次。由于核心序列重復(fù)次數(shù)的個體間差異,多數(shù)STR基因具有多態(tài)性。
不同個體來源的細胞在不同STR位點具有特異性的重復(fù)次數(shù),因而使得不同細胞具有其特征性的圖譜,根據(jù)圖譜的數(shù)據(jù)可以判定細胞是否為單一細胞。
近年來由于其檢測手段和技術(shù)方法的改進已經(jīng)廣泛應(yīng)用于遺傳制圖、基因定位、法醫(yī)學(xué)鑒定、人類學(xué)以及遺傳病的診斷等許多領(lǐng)域的研究,是目前應(yīng)用比較廣泛的遺傳標(biāo)記。
細胞STR鑒定的特點
STR圖譜鑒別通過標(biāo)準(zhǔn)化的操作,采用自動化的DNA分析儀對PCR產(chǎn)物進行**的分析,并以簡單的數(shù)字描述STR序列重復(fù)次數(shù),不僅增加了結(jié)果的客觀性,而且所需細胞數(shù)量少(低至1×103個細胞,
而細胞檢定中常規(guī)采用的同工酶法通常需要5×106個細胞),結(jié)果穩(wěn)定,特異性強??偟膩碚f,其分型快速、經(jīng)濟、易于自動化,可重復(fù)性好,且數(shù)據(jù)格式適合建立一個標(biāo)準(zhǔn)參考數(shù)據(jù)庫的特點,使得STR的應(yīng)用價值*大。
細胞STR鑒定的案例
已被描述的經(jīng)典案例是Hela細胞污染(關(guān)于Hela細胞污染有好幾個案例),令人驚奇的是,許多被Hela細胞污染的細胞系居然在一些備受尊敬的雜志上仍被使用,而這一使用距離它們*先發(fā)現(xiàn)為Hela細胞的時間長達40年之久。
T24是另外一種生長快速的細胞系,它常常污染許多經(jīng)推測來源于不同膀胱癌的細胞系。EVC304*先被認為是自發(fā)轉(zhuǎn)化的人類正常內(nèi)皮細胞系,但后來卻發(fā)現(xiàn)它是T24膀胱癌細胞系。令人感到意外的是,EVC304不是內(nèi)皮細胞的這一論述對它作為內(nèi)皮細胞模型的公開發(fā)表幾乎沒多大影響。
細胞STR鑒別刻不容緩
有許多緣由可以引起細胞培養(yǎng)物錯誤鑒定,每一個實驗室都存在風(fēng)險。
造成這種問題出現(xiàn)的原因有:實驗員的工作負荷,缺乏注意,在細胞操作過程中的分心,試劑的共用,耗材共用,在沒有充分分離每一細胞類型情況下同時對多個培養(yǎng)物進行操作等。
當(dāng)交叉污染發(fā)生時,一種細胞類型迅速生長而超過另一種,在4-5次細胞傳代后,一個純的污染細胞培養(yǎng)物將會形成。
異種移植也會導(dǎo)致細胞系交叉污染和錯誤鑒定,來自異種移植的復(fù)蘇細胞會被宿主動物細胞所替代。因此,由于這些缺乏重視及未采取質(zhì)控措施導(dǎo)致的細胞錯誤鑒定現(xiàn)象開始普遍。
但簡單、經(jīng)濟的質(zhì)控措施即可以阻止或至少會減少細胞錯誤鑒定的發(fā)生,這也被認為是生物制藥領(lǐng)域出現(xiàn)相對較低細胞錯誤鑒定報道的有效手段。
細胞系遭污染,也許很容易發(fā)生,但發(fā)生了對科學(xué)研究影響有多大?Nature社論文章稱,這要取決于實驗項目的類型。
比如說,細胞系被用作生化藥劑來源,混入其中的另外一種細胞則是無害的。但是,如果用這個細胞系來研究某一組織的特性則可能出現(xiàn)重大的失誤。因此,細胞鑒別格外重要。
沒有一個單一的方法可提供所有的信息來鑒定一個細胞系。
STR分型是這一時期的*佳代表。隨著新信息的可用,STR分型標(biāo)準(zhǔn)將會不斷地改進,不僅保證科研用細胞的正確性,還要作為生產(chǎn)用細胞的質(zhì)控方法,用于過程監(jiān)測。
素爾生物——細胞系培養(yǎng)&STR鑒定服務(wù)雙重服務(wù)
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不再擔(dān)心細胞黑身份,明明白白做實驗的方法,你get到了沒?